清代从康熙中叶至乾隆年间，农业生产逐渐从恢复走向发展，随之工商业也发展起来，北京成为全国的贸易中心。各少数民族地区的商品，如关东的韶皮、人参，西藏的红花、藏香，新疆的毡毯，蒙古的皮裘，以及云、贵等地的贵重药材，都出现在这里的市场上。北京（还有国内其他地方）则以瓷器、陶器、铁器、绸缎、布匹、烟、酒、茶、粮等重要商品，与少数民族地区进行贸易。北京的大商铺还供应蒙古、西藏等地需要的喇嘛念经用品和某些特别的手工艺品。清朝政府在城内御河两岸设立“里馆”，专门接待蒙古来京的客商，以加强与蒙古地区的商业联系。

清代将明北京的官营手工业改隶于内务府和工部等官署。内务府在京所设有内织染局、广储司七作（包括银作、铜作、染作、衣作、绣作、花作、皮作），营造司三作（包括铁作、漆作、炮作），工部在京所设有五大厂、五小厂和外三厂。它们的规模不及明代，但民间手工业在康熙后有了明显的发展，如铸铜、刀剪、制药、酿酒、香蜡、糖果、地毯、宫灯、雕漆、景泰蓝等技术更为精湛。

清代北京经济发展的一个特点是“前三门”（祟文门、正阳门、宣武门），尤其是正阳门即前门外一带特别繁荣。崇文门设有税关，门内往西有会同四译馆。东便门外通惠河至张家湾，由大运河运来的南方货物在这里集散。宣武门外有许多会馆。当时士子常出入宣武门，商人多出入崇文门，官员上下朝多进出正阳门。正阳门外大街一带，店铺林立，商众云集，摩肩接踵，喧嚣交易，是清代北京最繁华的闹市区。六必居、同仁堂、都一处、合香楼等著名店铺林立，牌匾相望。珠宝店、绸布店、粮食店、杂货店林林总总，盛极一时。在前三门商业区中，还出现了以经营经史子集、文房四宝、碑帖字画和印玺古玩为特色的琉璃厂文化街。每年新春，厂甸有集市，书店和其他商贩都在此设摊，成为北京的岁时盛事。

在教育方面，全国最高学府国子监，既有汉、满、蒙古等族儒生，也有日本、越南、朝鲜、琉球、俄罗斯的学生。此外，还有为宗室子弟所设的宗学，为觉罗子弟所设的觉罗学，为八旗子弟所设的八旗学，以及为汉族等子弟所设的顺天府学、宛平县学、大兴县学和金台书院等。清代各地举人大体上每三年到北京参加一次会试。清代共举行会试114科，有26846人在京成为进士。同治元年（1862）设京师同文馆，有英文馆、法文馆、德文馆、俄文馆和日文馆，后增设算术馆，研修外国语文和自然科学。光绪二年（1876）建立了京师博物馆。光绪二十四年（1898）建京师大学堂，是中国近代最早的大学。光绪二十八年（1902），京师大学堂设师范馆。清代西方教会还在北京兴办了育英、崇实、汇文、贝满等中学。宣统元年（1909）建立京师图书馆。中国的新闻事业始于清代，北京出版的早期报纸有《官局书报》、《顺天日报》、《启蒙画报》、《京论日报》、《北京女报》等。